تعریف چند مفهوم در توالی پالس EPI

یکی از مهمترین توالی های پالس در MRI که بسیار در fMRI هم کاربرد داره EPI است. در اسکنرهای زیمنس وقتی محیط سینگو (نرم افزار زیمنس که اپراتور با اون کار میکنه) باز و پروتکل مربوط به EPI رو می خواهیم ویرایش و سپس اجرا کنیم پارامترهای بسیار زیادی برای تغییر وجود دارند. در بین توالی پالس هایی که دیدم، EPI پیچیده ترین و پر تنظیمات ترین اونها بوده. در اینجا  سه مفهوم رو ذکر میکنم که با این توالی پالس مرتبط هستند و چه بسا در پروتکل بتونید اونها رو ببینید:

EPI Factor: نشان دهنده این است که بعد از یک پالس RF چه تعداد از خطوط فضای K پر شوند.

Echo spacing: وقتی خطوط مختلف از فضای K رو بعد از یک پالس پر می کنیم، فاصله زمانی که بین دو اکو وجود داره رو Echo Spacing نام گزاری شده. وقتی EPI Factor ما ۶۴ باشه یعنی بعد از یک پالس RF ما ۶۴ خط از فضای K رو پر می کنیم و هر بار که یک خط رو پر می کنیم یک اکو در واقع از سیگنال گرفتیم. فاصله ی بین دو اکو Echo spacing نام داره که طبیعتا واحد اون ms است. زیاد شدن مقدار Echo spacing در حفظ پهنای باند نیازمند افزایش TR و TE است.

پروتکل و گزینه ی Echo Spacing

tSNR: معمولا هنگام fMRI  از یک حجم مشخص در زمان های پشت سر هم تصویر گرفته میشه. یعنی ممکن هست که یک ووکسل خاص در حجم رو انتخاب کنیم و سیر تغییرات اون ووکسل رو در زمان مشاهده کنیم. tSNR در یه دیتاست fMRI به این صورت محاسبه میشه که میانگین مقادیر یک ووکسل رو در زمان های مختلف بر مقدار انحراف از معیار اون تقسیم می کنند و یک نقشه ای از tSNR اون حجم حاصل میشه. تغییراتی که در مقادیر یک ووکسل در طول زمان ایجاد شده می تونه به خاطر نویز و یا عملکرد فیزیولوژیک سابجکت باشه.

مفهوم tSNR در تصاویر fMRI